More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2142 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  100 
 
 		 324 aa  631  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  60.85 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  33.99 
 
 		 603 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  34.85 
 
 		 603 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.77 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  31.48 
 
 		 616 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  32.9 
 
 		 830 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.01 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.78 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1974  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  29.15 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  31.68 
 
 		 606 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  34.69 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 415 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  30.49 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.58 
 
 		 646 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  31.42 
 
 		 608 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0563  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.07 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000316396  normal  0.689961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  30.77 
 
 		 646 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  30.9 
 
 		 593 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  30.9 
 
 		 593 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1741  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 637 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  33.57 
 
 		 832 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 562 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>