More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1252 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  58.46 
 
 		 586 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.03 
 
 		 581 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  58.28 
 
 		 583 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.93 
 
 		 581 aa  690    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  57.63 
 
 		 581 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.93 
 
 		 581 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  58.62 
 
 		 592 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  58.59 
 
 		 581 aa  685    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  100 
 
 		 580 aa  1195    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  59.04 
 
 		 580 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  58.32 
 
 		 583 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  58.45 
 
 		 583 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  66.15 
 
 		 578 aa  788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  58.15 
 
 		 583 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  56.4 
 
 		 577 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  55.48 
 
 		 573 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  42.91 
 
 		 580 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  39.78 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  41.12 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  40 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  32.8 
 
 		 664 aa  264  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.05 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.15 
 
 		 581 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.28 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.75 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.16 
 
 		 627 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.48 
 
 		 584 aa  207  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.01 
 
 		 526 aa  206  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.1 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  28.44 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.48 
 
 		 523 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.22 
 
 		 591 aa  203  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  29.07 
 
 		 663 aa  203  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.74 
 
 		 555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  27.96 
 
 		 625 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.79 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  26.64 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.44 
 
 		 657 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.32 
 
 		 659 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  27.6 
 
 		 663 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.51 
 
 		 532 aa  177  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.18 
 
 		 607 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  26.29 
 
 		 637 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  26.29 
 
 		 637 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.68 
 
 		 672 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  25.83 
 
 		 641 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.24 
 
 		 605 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.42 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.7 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 		 582 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.89 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  26.34 
 
 		 619 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.18 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.95 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.41 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.86 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.09 
 
 		 515 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.93 
 
 		 1202 aa  104  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.88 
 
 		 1181 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.54 
 
 		 1215 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.85 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.79 
 
 		 1175 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  21.59 
 
 		 504 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  24.85 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.81 
 
 		 520 aa  91.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.85 
 
 		 516 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  22.86 
 
 		 772 aa  92  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  22.86 
 
 		 772 aa  92  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.63 
 
 		 503 aa  91.3  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  23.9 
 
 		 508 aa  90.1  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 315 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.26 
 
 		 508 aa  87.8  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.26 
 
 		 508 aa  87.8  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  22.47 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  22.28 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  22.46 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  22.28 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  28.69 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2912  metallophosphoesterase  23.28 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  22.46 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.3 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  22.28 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  22.32 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.85 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  22.28 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  22.93 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  22 
 
 		 529 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.22 
 
 		 518 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  21.92 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  20.78 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  22.59 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.05 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  21.43 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  23.22 
 
 		 518 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  24.22 
 
 		 529 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  23.03 
 
 		 518 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  24.04 
 
 		 529 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  29.08 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3060  metallophosphoesterase  22.96 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  23.03 
 
 		 518 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>