153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0551 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0551  HPP  100 
 
 		 173 aa  336  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  47.27 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  46.67 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  46.67 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  46.67 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  46.39 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  46.67 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  46.06 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  46.67 
 
 		 184 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  49.12 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  41.07 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.65 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  42.86 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  43.51 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  42.21 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  49.26 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  41.67 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  41.51 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  41.51 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  39.52 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  41.56 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  35.59 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  37.97 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  45.9 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  48.33 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  53.27 
 
 		 120 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  43.12 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  35.9 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  39.84 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  37.24 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  36.31 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  38.89 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  41.74 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  31.07 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  36 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  39.16 
 
 		 379 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  36.55 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  39.19 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  37.35 
 
 		 379 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  39.05 
 
 		 379 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  39.05 
 
 		 379 aa  94  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  36.14 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 		 361 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  33.93 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  41.33 
 
 		 400 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  34.27 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.78 
 
 		 383 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  40.48 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 		 392 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 		 374 aa  87.8  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  42.97 
 
 		 416 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 182 aa  87.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  39.88 
 
 		 404 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 390 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  44 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  44 
 
 		 376 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  34.67 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  41.01 
 
 		 373 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 397 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  32.95 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39.86 
 
 		 382 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 397 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  39.86 
 
 		 397 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 465 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 382 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  43.64 
 
 		 391 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  40.43 
 
 		 388 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  35.84 
 
 		 178 aa  84  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  33.9 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  33.54 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  42.07 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  32.77 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  33.33 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  33.9 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  33.33 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  33.33 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 449 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  44.55 
 
 		 346 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.56 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  32.39 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  32.39 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  32.39 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  30.81 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  32.9 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 		 405 aa  80.9  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 		 405 aa  80.9  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  32.43 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.21 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  37.5 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  39.29 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  29.41 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  43.65 
 
 		 401 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  34.69 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  35.37 
 
 		 368 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>