276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2012 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
398 aa  827    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  65.33 
 
 
395 aa  554  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  38.4 
 
 
368 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  35.13 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.98 
 
 
313 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.38 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.98 
 
 
345 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.65 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
334 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
379 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 
328 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 
727 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
335 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.98 
 
 
312 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
423 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
400 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  24.16 
 
 
325 aa  106  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
317 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
370 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 
338 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
331 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.46 
 
 
328 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
474 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.82 
 
 
388 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.11 
 
 
405 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
359 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  25.84 
 
 
440 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 
329 aa  99  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.67 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  29.45 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.3 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.23 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.67 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 
415 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 
373 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.47 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.47 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  25.53 
 
 
421 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  29.97 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25.99 
 
 
320 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.93 
 
 
348 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
434 aa  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
454 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 
465 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.13 
 
 
657 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  24.72 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.97 
 
 
409 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
311 aa  87  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  28.95 
 
 
495 aa  87  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.77 
 
 
424 aa  87  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  28.21 
 
 
471 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.48 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  27.27 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.81 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0727  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00617337  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  25.56 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  25.67 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.91 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  27.27 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.23 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  23.54 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  23.42 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  26.93 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
313 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  24.53 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>