More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0020 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  100 
 
 
539 aa  1106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  47.33 
 
 
525 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  46.2 
 
 
524 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  44.69 
 
 
530 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  44.05 
 
 
532 aa  459  1e-128  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  43.45 
 
 
526 aa  452  1e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.45 
 
 
526 aa  452  1e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  43.5 
 
 
526 aa  441  1e-122  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  44.51 
 
 
538 aa  441  1e-122  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  41.37 
 
 
524 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  41.24 
 
 
524 aa  418  1e-115  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  41.04 
 
 
524 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  41.24 
 
 
524 aa  418  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  41.04 
 
 
524 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  41.24 
 
 
524 aa  418  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  41.43 
 
 
524 aa  418  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  41.41 
 
 
524 aa  417  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  41.24 
 
 
524 aa  416  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  40.84 
 
 
524 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  38.78 
 
 
523 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.5 
 
 
513 aa  404  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  4.77414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2277  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding  43.48 
 
 
553 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0883096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.61 
 
 
488 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3342  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.61 
 
 
524 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  38.34 
 
 
544 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  5.91223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  37.23 
 
 
532 aa  363  6e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  37.23 
 
 
532 aa  363  6e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2372  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  37.23 
 
 
532 aa  359  7e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  38.76 
 
 
538 aa  358  1e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
537 aa  216  1e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
549 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
526 aa  204  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  27.82 
 
 
511 aa  201  4e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  27.93 
 
 
538 aa  186  1e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
546 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
547 aa  170  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
544 aa  169  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
542 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.34 
 
 
516 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
551 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 
541 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
537 aa  150  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49168  predicted protein  30.45 
 
 
597 aa  149  1e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
546 aa  148  2e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  29.7 
 
 
546 aa  148  2e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
546 aa  148  2e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 
534 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.57 
 
 
511 aa  148  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.30411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
512 aa  147  4e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.06 
 
 
510 aa  147  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
535 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.06 
 
 
532 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.67 
 
 
511 aa  145  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.09 
 
 
535 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
537 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 
517 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.39 
 
 
509 aa  140  4e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
551 aa  140  4e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
564 aa  140  5e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
519 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.42 
 
 
541 aa  140  8e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
490 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
555 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.69 
 
 
526 aa  138  3e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.32073e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 
544 aa  138  3e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.42 
 
 
520 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.45 
 
 
524 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
508 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
505 aa  137  7e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 
509 aa  134  4e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.17 
 
 
524 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.81 
 
 
505 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.04 
 
 
502 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
544 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
519 aa  133  1e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
498 aa  130  5e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
528 aa  128  2e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
532 aa  129  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 
515 aa  127  4e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
535 aa  127  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
511 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  28.91 
 
 
553 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
565 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
566 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.47 
 
 
517 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
522 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.94 
 
 
556 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 
544 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  24.32 
 
 
518 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.67 
 
 
528 aa  123  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.67 
 
 
550 aa  123  1e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
499 aa  122  1e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
524 aa  122  2e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 
535 aa  122  2e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.14 
 
 
526 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.14 
 
 
526 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
516 aa  122  2e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.14 
 
 
526 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 
535 aa  122  2e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
501 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>