286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0008 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  63.88 
 
 
508 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
504 aa  1037    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
504 aa  1037    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  63.21 
 
 
505 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  63.21 
 
 
505 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  63.21 
 
 
505 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  63.01 
 
 
505 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  62.8 
 
 
505 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 
505 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  63.01 
 
 
505 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  63.01 
 
 
505 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  62.55 
 
 
506 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  63.01 
 
 
505 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  62.35 
 
 
505 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  60.04 
 
 
504 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
516 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  51.83 
 
 
508 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  48.47 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  48.44 
 
 
507 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  46.47 
 
 
511 aa  432  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
516 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  44.76 
 
 
509 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  43.09 
 
 
498 aa  405  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  44.83 
 
 
520 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  42.48 
 
 
523 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 
499 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.36 
 
 
508 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  44.09 
 
 
508 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  43.85 
 
 
526 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
508 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  39.84 
 
 
497 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  41.89 
 
 
528 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  40.92 
 
 
511 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 
513 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  42.2 
 
 
515 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.08 
 
 
506 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.19 
 
 
536 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  43.43 
 
 
517 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  42.8 
 
 
506 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
515 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 
507 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  41.58 
 
 
505 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
511 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  43.45 
 
 
513 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 
519 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  40.52 
 
 
506 aa  364  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  41.93 
 
 
511 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
510 aa  362  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  38.88 
 
 
489 aa  362  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  39.24 
 
 
511 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  42.89 
 
 
511 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  43.97 
 
 
515 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 
511 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
510 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  41.93 
 
 
511 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  39.16 
 
 
513 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  39.16 
 
 
513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  39.16 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  39.51 
 
 
511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  41.03 
 
 
506 aa  356  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  42.76 
 
 
514 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  41.55 
 
 
511 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38.76 
 
 
513 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  39.2 
 
 
510 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  38.96 
 
 
513 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
535 aa  356  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  43.41 
 
 
503 aa  355  8.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  40.52 
 
 
510 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  41.16 
 
 
512 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  41.03 
 
 
506 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 
511 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
510 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  37.98 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  38.82 
 
 
497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  39.4 
 
 
510 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
510 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 
509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  39.68 
 
 
510 aa  352  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  38.42 
 
 
511 aa  352  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  43.07 
 
 
517 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 
513 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  40.2 
 
 
510 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  37.98 
 
 
511 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  39.35 
 
 
513 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  40.45 
 
 
507 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  41.04 
 
 
509 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 
506 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 
533 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  41.01 
 
 
507 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  40.57 
 
 
514 aa  349  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  43.17 
 
 
508 aa  349  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  41.01 
 
 
507 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  38.37 
 
 
514 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>