55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3217 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 340 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  33.23 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  34.05 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  27.3 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  27.16 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  26.69 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  24.36 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  24.46 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  26.35 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  28.79 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  26.05 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  25.89 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  27.05 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  26.04 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  27.85 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  23.1 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  25.75 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  26.42 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  26.09 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  25.41 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  27.12 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  25.3 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  26.51 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  26.53 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  26.54 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  26.42 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25.91 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  30.18 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.2 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.83 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.91 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  27.76 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  25.94 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.64 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  24.64 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  23.98 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  24.02 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.51 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  23.93 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  22.05 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  22.64 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  27.01 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>