127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0016 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
209 aa  404  1e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  64 
 
 
556 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  5.05558e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  63.43 
 
 
554 aa  197  1e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  64.37 
 
 
546 aa  194  8e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  61.49 
 
 
477 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  61.26 
 
 
554 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  56.25 
 
 
569 aa  183  2e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.4 
 
 
567 aa  182  4e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  61.14 
 
 
570 aa  178  6e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  58.62 
 
 
555 aa  174  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  56 
 
 
558 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  57.14 
 
 
577 aa  168  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  62.99 
 
 
555 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  66.23 
 
 
560 aa  165  6e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  58.52 
 
 
566 aa  163  2e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  56.02 
 
 
551 aa  162  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  53.14 
 
 
553 aa  161  8e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  69.17 
 
 
563 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  58.97 
 
 
561 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  4.43731e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  51.15 
 
 
558 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  67.24 
 
 
579 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  4.96688e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  51.72 
 
 
792 aa  121  1e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  52.14 
 
 
784 aa  119  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  6.06887e-05  hitchhiker  5.03803e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  51.37 
 
 
778 aa  116  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  3.46041e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  43.79 
 
 
1848 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  49.28 
 
 
837 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  48.63 
 
 
776 aa  109  4e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  9.57147e-05  hitchhiker  4.2388e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2494  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.14 
 
 
209 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  48.57 
 
 
553 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  43.8 
 
 
403 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  43.36 
 
 
593 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  43.33 
 
 
376 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.36 
 
 
417 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.41189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  39.86 
 
 
450 aa  89  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.84 
 
 
706 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  42.4 
 
 
443 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.15 
 
 
821 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  38.52 
 
 
461 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.72 
 
 
454 aa  85.5  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.42625e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.07 
 
 
1679 aa  85.1  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  37.82 
 
 
737 aa  84.7  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  38.19 
 
 
461 aa  83.2  3e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.6 
 
 
818 aa  82.4  4e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  43.26 
 
 
835 aa  82  5e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.07 
 
 
2082 aa  82  6e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  41.79 
 
 
717 aa  81.3  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  45.24 
 
 
681 aa  80.5  2e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  43.7 
 
 
714 aa  80.1  2e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.49 
 
 
1919 aa  80.1  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  39.5 
 
 
911 aa  80.5  2e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  39.58 
 
 
1129 aa  79.3  4e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.62 
 
 
469 aa  79.3  4e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.67445e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1070  hypothetical protein  53.57 
 
 
177 aa  78.2  9e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152299  hitchhiker  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.26 
 
 
941 aa  76.6  2e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  39.1 
 
 
363 aa  76.6  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  39.1 
 
 
363 aa  76.6  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.58 
 
 
810 aa  75.9  4e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  34.53 
 
 
390 aa  75.5  5e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  37.98 
 
 
332 aa  74.7  9e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  37.82 
 
 
535 aa  74.3  1e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  35.29 
 
 
807 aa  73.9  2e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  34.46 
 
 
547 aa  72.8  4e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  34.19 
 
 
341 aa  72.4  5e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  36.84 
 
 
454 aa  72  5e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  36.13 
 
 
1312 aa  71.6  8e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.56 
 
 
728 aa  71.2  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.26417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  34 
 
 
1207 aa  70.9  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  36.44 
 
 
449 aa  70.9  1e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.51 
 
 
692 aa  70.1  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  42.37 
 
 
743 aa  70.1  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  37.01 
 
 
1222 aa  70.5  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  36.29 
 
 
328 aa  68.9  4e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  29.53 
 
 
375 aa  68.9  5e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  37.96 
 
 
638 aa  68.2  9e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  39.84 
 
 
624 aa  67.8  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  39.13 
 
 
900 aa  67.8  1e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.1 
 
 
787 aa  66.2  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  36.81 
 
 
389 aa  65.1  8e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.29 
 
 
817 aa  64.7  9e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.59 
 
 
618 aa  64.3  1e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  34.27 
 
 
1187 aa  64.7  1e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  37.11 
 
 
106 aa  63.5  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  40 
 
 
547 aa  62.8  3e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.42 
 
 
726 aa  62  6e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  32.56 
 
 
558 aa  61.6  7e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  34.09 
 
 
727 aa  61.6  8e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.1 
 
 
643 aa  61.6  9e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.71 
 
 
326 aa  60.1  2e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  30.99 
 
 
447 aa  60.1  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  36.59 
 
 
533 aa  59.7  3e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  35.34 
 
 
375 aa  59.7  3e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.04 
 
 
1126 aa  60.1  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  36.84 
 
 
575 aa  59.3  4e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  33.11 
 
 
602 aa  58.9  5e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
745 aa  58.2  8e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  33.33 
 
 
371 aa  56.2  3e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  29.86 
 
 
399 aa  56.2  4e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  31.47 
 
 
212 aa  56.2  4e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  36.51 
 
 
544 aa  55.5  5e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.87 
 
 
921 aa  55.5  6e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>