49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2494 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2494  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
209 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  53.24 
 
 
566 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.03 
 
 
570 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  54.76 
 
 
579 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  53.37 
 
 
569 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  50.8 
 
 
558 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  60.43 
 
 
553 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  45.21 
 
 
558 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  52.38 
 
 
551 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  48.99 
 
 
567 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.91 
 
 
555 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  43.09 
 
 
560 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.05 
 
 
555 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  59.63 
 
 
477 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  59.81 
 
 
556 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.01 
 
 
554 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  49.36 
 
 
554 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  51.69 
 
 
546 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  39.5 
 
 
577 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.91 
 
 
209 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.94 
 
 
563 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1070  hypothetical protein  61.45 
 
 
177 aa  95.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152299  hitchhiker  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.4 
 
 
561 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  51.32 
 
 
784 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  45.36 
 
 
1848 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  50 
 
 
778 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  50 
 
 
792 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  40.32 
 
 
776 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  53.57 
 
 
403 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.9 
 
 
837 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.95 
 
 
389 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.83 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  36.71 
 
 
450 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.59 
 
 
553 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  51.92 
 
 
737 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  29.66 
 
 
443 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  47.54 
 
 
2082 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  55.32 
 
 
726 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  34.69 
 
 
743 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
454 aa  45.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  40.24 
 
 
593 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.29 
 
 
717 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.33 
 
 
461 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  40 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.27 
 
 
1919 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
745 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  35.29 
 
 
911 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.4 
 
 
818 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  43.1 
 
 
714 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>