30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1070 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  342  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152299  hitchhiker  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  64.22 
 
 		 567 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  61.68 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2494  regulator of chromosome condensation, RCC1  58.25 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  61.68 
 
 		 577 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  51.3 
 
 		 477 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  55.96 
 
 		 553 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  56.88 
 
 		 551 aa  98.2  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.85 
 
 		 554 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  53.27 
 
 		 558 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.7 
 
 		 570 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  50.43 
 
 		 569 aa  87.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.88 
 
 		 556 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  55.06 
 
 		 554 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  55.81 
 
 		 560 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  50 
 
 		 555 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.35 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  55.06 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  47.17 
 
 		 546 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.14 
 
 		 563 aa  61.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.98 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  48.53 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  62.26 
 
 		 561 aa  58.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.67 
 
 		 1848 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  54.9 
 
 		 792 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  46.25 
 
 		 784 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  58.33 
 
 		 776 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  42.11 
 
 		 778 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 403 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  31.96 
 
 		 450 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>