45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0535 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 908 aa  1830    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  37.72 
 
 		 917 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  36.33 
 
 		 980 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  37.5 
 
 		 918 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 		 943 aa  572  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  34.97 
 
 		 948 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  34.88 
 
 		 941 aa  549  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  34.8 
 
 		 953 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  33.55 
 
 		 942 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  34.57 
 
 		 939 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  33.77 
 
 		 961 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 922 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  31.18 
 
 		 948 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  30.59 
 
 		 933 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 917 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  31.12 
 
 		 923 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  31.11 
 
 		 970 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  30.98 
 
 		 919 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  32.91 
 
 		 948 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  31.23 
 
 		 925 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  29.98 
 
 		 985 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1002 aa  304  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  29.45 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  36.21 
 
 		 305 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  35.29 
 
 		 321 aa  160  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  34.66 
 
 		 262 aa  144  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  21.28 
 
 		 764 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  25.88 
 
 		 286 aa  94.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  23.36 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  26.52 
 
 		 518 aa  77  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  22.66 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  27.63 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  24.55 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  24.2 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  24.19 
 
 		 273 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  23.97 
 
 		 258 aa  64.3  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  23.2 
 
 		 231 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  26.32 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  27.54 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.35 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 323 aa  56.6  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  26.12 
 
 		 272 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 286 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  25.71 
 
 		 272 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 392 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>