53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4121 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  53.32 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  54.38 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  54.66 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  46.7 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  44.8 
 
 		 364 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  44.8 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  44.66 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  44.23 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  31.74 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  45.75 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  42.61 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  47.83 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  27.96 
 
 		 278 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  38.41 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  44.44 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  45.45 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  38.17 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  39.2 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  43.75 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  42.47 
 
 		 1359 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  37.5 
 
 		 1408 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1135 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1143 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1149 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1147 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1148 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  37.29 
 
 		 1761 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1110 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  39.24 
 
 		 937 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1129 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1124 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1115 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  33.77 
 
 		 1057 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  36.67 
 
 		 945 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  36.51 
 
 		 1247 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1097 aa  49.3  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  35 
 
 		 895 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  45.1 
 
 		 1245 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  34.02 
 
 		 896 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1273 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  42.62 
 
 		 927 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  42.62 
 
 		 924 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  39.22 
 
 		 946 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.06 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.09 
 
 		 744 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  38.33 
 
 		 897 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  42.59 
 
 		 806 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1621 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  36.11 
 
 		 822 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1162 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 604 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  34.25 
 
 		 957 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>