More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1658 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 644 aa  1322    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  79.2 
 
 		 642 aa  1049    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  79.2 
 
 		 642 aa  1049    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 641 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  47.43 
 
 		 644 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  45.55 
 
 		 659 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 		 640 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  45.55 
 
 		 658 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 644 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 659 aa  600  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  45.71 
 
 		 658 aa  601  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  44.97 
 
 		 662 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 644 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  44.36 
 
 		 645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  45.68 
 
 		 635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  45.2 
 
 		 639 aa  559  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 636 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  41.86 
 
 		 636 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  43.93 
 
 		 638 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  41.88 
 
 		 643 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  40.34 
 
 		 630 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  38.04 
 
 		 657 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  38.02 
 
 		 634 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  39.69 
 
 		 643 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 643 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  38.54 
 
 		 666 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  36.24 
 
 		 649 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 767 aa  429  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  41.64 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 638 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.53 
 
 		 581 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  35.14 
 
 		 649 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  36 
 
 		 641 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  42.57 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  42.55 
 
 		 569 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  36.09 
 
 		 639 aa  415  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  43.18 
 
 		 567 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  36.41 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.69 
 
 		 645 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.23 
 
 		 672 aa  395  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  36.49 
 
 		 637 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.63 
 
 		 668 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.23 
 
 		 649 aa  399  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  41.08 
 
 		 564 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  37.13 
 
 		 640 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  37.97 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 632 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.28 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.35 
 
 		 659 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 		 645 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  39.11 
 
 		 690 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  32.59 
 
 		 659 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  38.73 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  40 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  36.48 
 
 		 638 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.92 
 
 		 540 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  34.97 
 
 		 667 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  40.22 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  38.55 
 
 		 541 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  40.4 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.54 
 
 		 620 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.69 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.77 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  34.71 
 
 		 648 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  34.88 
 
 		 641 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  37.13 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.2 
 
 		 543 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.61 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.88 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 627 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  34.25 
 
 		 636 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 648 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  38.36 
 
 		 653 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  39.59 
 
 		 574 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 544 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.45 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.16 
 
 		 709 aa  365  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 545 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  37.25 
 
 		 540 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 641 aa  364  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  36.07 
 
 		 560 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  32.32 
 
 		 644 aa  363  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 540 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  36.21 
 
 		 549 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.98 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.91 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  34.52 
 
 		 619 aa  357  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 		 546 aa  356  5.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 663 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  37.65 
 
 		 583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 663 aa  353  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.88 
 
 		 667 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.8 
 
 		 541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.35 
 
 		 540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 650 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>