167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1429 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  86.31 
 
 		 243 aa  428  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  86.31 
 
 		 243 aa  428  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  52.36 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.25 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  46.61 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.96 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  47.28 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  44.3 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.02 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.87 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.66 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  44.12 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  42.15 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  40.32 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  39.36 
 
 		 744 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  42.56 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  43.22 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.91 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  37.9 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.27 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.92 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.25 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.32 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.28 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  45.54 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.14 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.86 
 
 		 242 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.1 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.1 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  40.85 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  35.59 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.46 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  39.62 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.21 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  33.61 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  39.15 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  32.05 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.72 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  34.31 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.84 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  34.88 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  34.39 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.09 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  37.09 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  33.78 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  37.09 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  34.53 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  33.76 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  34.91 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.47 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.97 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.05 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.85 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  36 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  35.96 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  35.68 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  33.96 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.96 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  31.84 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.65 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.11 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  33.57 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  28.42 
 
 		 487 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  29.7 
 
 		 534 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  29.17 
 
 		 492 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  28.79 
 
 		 492 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 		 454 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  28.35 
 
 		 481 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  29.66 
 
 		 514 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  27.74 
 
 		 534 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  33.94 
 
 		 484 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  31.47 
 
 		 492 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  28.08 
 
 		 487 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  31.76 
 
 		 494 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  29.41 
 
 		 483 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  28.49 
 
 		 501 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  25.64 
 
 		 514 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  29.93 
 
 		 524 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  30.63 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 		 489 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  25.15 
 
 		 507 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  26.85 
 
 		 494 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  33.02 
 
 		 483 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  28.08 
 
 		 487 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3196  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 		 475 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  33.02 
 
 		 506 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  29.67 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  27.5 
 
 		 484 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  27.96 
 
 		 518 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  29.49 
 
 		 485 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  24.75 
 
 		 495 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  30 
 
 		 538 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0078  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 469 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  25.54 
 
 		 518 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  28.39 
 
 		 505 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>