More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0042 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  553  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
292 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
292 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
292 aa  88.6  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  28.17 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
283 aa  82.4  8e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  24.26 
 
 
292 aa  81.3  2e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  26.34 
 
 
291 aa  79.7  4e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  25.66 
 
 
320 aa  79.7  5e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  25.1 
 
 
333 aa  79.3  5e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  26 
 
 
304 aa  78.6  1e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
282 aa  78.2  1e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
282 aa  78.2  1e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
282 aa  77.8  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
278 aa  77.4  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  2.55705e-07 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  77.4  2e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  77.4  2e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  77.4  2e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
284 aa  76.6  3e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  25.84 
 
 
287 aa  76.3  4e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.15 
 
 
282 aa  76.6  4e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 
315 aa  76.3  5e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  24.81 
 
 
282 aa  76.3  5e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  7.84459e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
280 aa  76.3  5e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  24 
 
 
266 aa  75.1  1e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  24.55 
 
 
281 aa  74.7  1e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  24 
 
 
266 aa  75.1  1e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
284 aa  74.3  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  23.75 
 
 
282 aa  73.6  3e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  23.23 
 
 
272 aa  73.2  4e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  3.02216e-10 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
273 aa  72.8  6e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  23.44 
 
 
284 aa  72.8  6e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.96 
 
 
299 aa  72.8  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
296 aa  72.4  7e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  24.15 
 
 
281 aa  72.4  8e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  7.07391e-09 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  22.69 
 
 
342 aa  72  8e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  24.91 
 
 
301 aa  71.6  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  23.44 
 
 
284 aa  71.6  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.43664e-05 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  24.1 
 
 
273 aa  70.5  2e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  24.41 
 
 
327 aa  70.1  3e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
282 aa  70.5  3e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0550  RpiR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
287 aa  70.1  3e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  23.44 
 
 
320 aa  70.5  3e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.71 
 
 
282 aa  70.1  3e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  23.05 
 
 
284 aa  70.1  4e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  21.63 
 
 
274 aa  69.7  5e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  24.8 
 
 
296 aa  69.3  6e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  24.8 
 
 
296 aa  69.3  6e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.43 
 
 
282 aa  69.3  7e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.43 
 
 
282 aa  68.9  7e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.43 
 
 
282 aa  68.9  7e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  27.11 
 
 
250 aa  69.3  7e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.43 
 
 
282 aa  68.9  7e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  25.77 
 
 
285 aa  68.6  9e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0640  transcriptional regulator, RpiR family  24.64 
 
 
296 aa  68.6  1e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.360416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  23.51 
 
 
304 aa  68.6  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  24.51 
 
 
296 aa  68.6  1e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.43 
 
 
282 aa  68.6  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  25.36 
 
 
279 aa  68.2  1e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  24.51 
 
 
296 aa  68.6  1e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
270 aa  68.6  1e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  24.51 
 
 
296 aa  68.6  1e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.46 
 
 
279 aa  67.8  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.46 
 
 
279 aa  67.8  2e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  27.78 
 
 
283 aa  67.8  2e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.46 
 
 
279 aa  67.8  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0972  transcriptional regulator, RpiR family  24.9 
 
 
281 aa  67.4  2e-10  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  20 
 
 
280 aa  67.4  2e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
281 aa  67.4  3e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.53 
 
 
284 aa  66.6  4e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
318 aa  66.2  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  23.55 
 
 
320 aa  66.2  5e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
334 aa  66.2  6e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
339 aa  66.2  6e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
339 aa  65.9  7e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  22.9 
 
 
293 aa  65.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4059  RpiR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
295 aa  65.5  8e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682861  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  23.05 
 
 
289 aa  65.9  8e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3892  RpiR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
293 aa  65.5  9e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134896  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
293 aa  64.7  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
293 aa  64.7  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0365  RpiR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
297 aa  64.7  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
293 aa  64.7  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1556  putative transcription regulation repressor HEXR transcription regulator protein  21.39 
 
 
277 aa  64.7  2e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0695  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
305 aa  63.9  2e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674181  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0744  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
305 aa  63.9  2e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.72 
 
 
284 aa  64.3  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
282 aa  64.3  2e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
281 aa  64.7  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4899  RpiR family transcriptional regulator  23.41 
 
 
287 aa  63.5  3e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
332 aa  63.9  3e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.59 
 
 
282 aa  63.5  3e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  26.67 
 
 
284 aa  63.9  3e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  1.08566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
332 aa  63.9  3e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
332 aa  63.5  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.17 
 
 
284 aa  63.9  3e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
332 aa  63.5  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>