206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2804 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 145 aa  289  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.83 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  35.4 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.07 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.2 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.56 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.6 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  26.27 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 114 aa  57  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.45 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 249 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  29.13 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.03 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.02 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.69 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.36 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  26.8 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  26.42 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  26.77 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  26.47 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  23.96 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.93 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.43 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  32.89 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 269 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  25.49 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  30.51 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  30.51 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 250 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  27.88 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.74 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  27.78 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1374  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  30.21 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 237 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.12 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>