More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2548 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  100 
 
 		 321 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  65.02 
 
 		 303 aa  401  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  65.02 
 
 		 303 aa  401  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  63.82 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  59.22 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  61.37 
 
 		 298 aa  351  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  350  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  59.6 
 
 		 328 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  57.79 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  55.96 
 
 		 298 aa  344  8.999999999999999e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  59.79 
 
 		 298 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  58.8 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  56.36 
 
 		 282 aa  338  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  58.39 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  55.83 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  55.83 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  56.12 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  54.98 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  59.04 
 
 		 276 aa  329  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  54.7 
 
 		 326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  56.04 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  53.41 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  55.72 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  54.15 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  54.98 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  54.64 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  54.98 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  52.46 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  56.52 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  56.34 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  56.57 
 
 		 316 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 311 aa  321  9.000000000000001e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  52.94 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  55.79 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  53.1 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  53.17 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  58.03 
 
 		 296 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  52.26 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  56.83 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  55.52 
 
 		 331 aa  316  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  55.21 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  52.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  54.64 
 
 		 294 aa  315  5e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 290 aa  315  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  52.46 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  52.01 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  52.05 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  54.21 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  51.34 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  54.95 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  52.22 
 
 		 319 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  56 
 
 		 348 aa  311  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  53.09 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  54.61 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  56.43 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  51.35 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  53.85 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  53.11 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  54.95 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  55.23 
 
 		 326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  53.48 
 
 		 323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  54.42 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  53.43 
 
 		 355 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  51.6 
 
 		 322 aa  308  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  55.23 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  51.2 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  53.05 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  48.88 
 
 		 319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  52.6 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  49.83 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  50 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  55.23 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  51.01 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  49.49 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  53.09 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  51.01 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>