More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2185 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 633 aa  650    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.38 
 
 		 612 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.55 
 
 		 651 aa  655    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.53 
 
 		 614 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.83 
 
 		 637 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  53.92 
 
 		 700 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  54.1 
 
 		 638 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.98 
 
 		 640 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.83 
 
 		 633 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.23 
 
 		 660 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.3 
 
 		 612 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  52.17 
 
 		 649 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 		 639 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 		 669 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.83 
 
 		 634 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.49 
 
 		 657 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.23 
 
 		 610 aa  661    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  60.36 
 
 		 682 aa  708    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 		 657 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.03 
 
 		 640 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.06 
 
 		 610 aa  662    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.37 
 
 		 637 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.34 
 
 		 633 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  54.98 
 
 		 613 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.5 
 
 		 671 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  53.29 
 
 		 617 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.33 
 
 		 635 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.88 
 
 		 616 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 		 652 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 		 655 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.99 
 
 		 620 aa  679    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.39 
 
 		 617 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.58 
 
 		 639 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.73 
 
 		 608 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  55.45 
 
 		 665 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 		 634 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  52.66 
 
 		 617 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  55.03 
 
 		 613 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  52.99 
 
 		 617 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.51 
 
 		 611 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.95 
 
 		 638 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  57.07 
 
 		 645 aa  666    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.65 
 
 		 697 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  55.76 
 
 		 635 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.51 
 
 		 753 aa  671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  53.39 
 
 		 681 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.49 
 
 		 684 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 		 615 aa  709    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.94 
 
 		 639 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 		 657 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.31 
 
 		 614 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.24 
 
 		 640 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.08 
 
 		 607 aa  656    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 656 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.09 
 
 		 638 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  55.83 
 
 		 642 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.25 
 
 		 659 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  54.85 
 
 		 637 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 		 676 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.67 
 
 		 633 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.22 
 
 		 616 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  84.07 
 
 		 651 aa  1022    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  100 
 
 		 627 aa  1267    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 		 657 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.41 
 
 		 645 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.17 
 
 		 601 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55 
 
 		 601 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  53.91 
 
 		 612 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  55.59 
 
 		 613 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.6 
 
 		 638 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.6 
 
 		 657 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.6 
 
 		 657 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 		 634 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.97 
 
 		 635 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.07 
 
 		 599 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.15 
 
 		 687 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  55.83 
 
 		 639 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  59.96 
 
 		 689 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  54.12 
 
 		 639 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 652 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.87 
 
 		 753 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  58.2 
 
 		 693 aa  658    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.33 
 
 		 657 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  60.03 
 
 		 654 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 		 621 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.8 
 
 		 634 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  56.74 
 
 		 681 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.82 
 
 		 630 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.65 
 
 		 697 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.49 
 
 		 617 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.75 
 
 		 616 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.29 
 
 		 637 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  53.78 
 
 		 641 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.76 
 
 		 635 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>