More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2164 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  44.97 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  49.4 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.88 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  47.1 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.28 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  43.87 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 256 aa  120  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  40.8 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  40.8 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  43.09 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  39.66 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  39.75 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  41.46 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  40.11 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  40.11 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  37.08 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  38.65 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  43.42 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  38.41 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  42.22 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  39.61 
 
 		 203 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  37.71 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  38.04 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  35.43 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  35.86 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 202 aa  97.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  35.43 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>