124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3126 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  98.8 
 
 		 332 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  49.11 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  33.44 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  31.01 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  30.66 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  32.8 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  29.93 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.75 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  34.01 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  32.25 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  31.66 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  34.98 
 
 		 377 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  31.58 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  32.41 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.34 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.34 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  32.49 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  30.53 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  29.02 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.87 
 
 		 370 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  29.43 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.87 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.55 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  32.18 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  27.55 
 
 		 356 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.43 
 
 		 349 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  25.68 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.43 
 
 		 349 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.43 
 
 		 349 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  30.75 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  27.76 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  28.93 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  27.55 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  28.17 
 
 		 356 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  27.55 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.28 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  30.1 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.58 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.22 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.77 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.35 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.3 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.13 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  29.55 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  31.01 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  27.8 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  31.01 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  31.01 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  31.01 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  31.01 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  30.83 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  31.01 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  28.9 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  32.03 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  27.78 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  27.89 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  27.3 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  27.3 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  31.68 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  31.68 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  27.47 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  30.8 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  27.45 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  27.45 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  27.45 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  27.2 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  27.17 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  34.65 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  24.24 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  23.94 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  23.94 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  27.64 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  26.4 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  28.26 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  22.05 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  25.53 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  26.36 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  26.64 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  26.1 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  26.2 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  26.14 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  23.55 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  28.82 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  29.5 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1896  hypothetical protein  25.69 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0443  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2079  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0744  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1039  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0794  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.990033  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0705  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>