120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0020 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  84.87 
 
 		 456 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  84.87 
 
 		 456 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  67.11 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  58.68 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  54.55 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  58.13 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 463 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 465 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  36.23 
 
 		 455 aa  289  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 462 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  37.35 
 
 		 440 aa  266  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  35.15 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 474 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  32.88 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  32.06 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  32.21 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.38 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  31.39 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.51 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 419 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 462 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  31.11 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  30.77 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 460 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 		 443 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  24.78 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.12 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.9 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 441 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.9 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.9 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.9 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.9 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.9 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.68 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  31.24 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.61 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  27.81 
 
 		 453 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  25.58 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 572 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  27.56 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 426 aa  97.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  24.73 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  27.35 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  26.96 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 404 aa  90.1  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 444 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.06 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  25.44 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  22.72 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  22.08 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>