More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2130 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
202 aa  390  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  3.91872e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.83 
 
 
205 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  38.31 
 
 
205 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  41.36 
 
 
205 aa  129  2e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 
230 aa  127  8e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  39.79 
 
 
205 aa  126  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
205 aa  126  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.81 
 
 
242 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  39.01 
 
 
212 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
203 aa  120  1e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 
206 aa  117  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
203 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 
203 aa  112  4e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  41.48 
 
 
205 aa  110  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  32.35 
 
 
207 aa  108  4e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
206 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 
203 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  35.87 
 
 
207 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  1.45641e-12 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.09 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  34.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.41 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.5376e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.09 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  34.85 
 
 
255 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.34 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.1 
 
 
218 aa  84  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.1 
 
 
218 aa  83.2  2e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
204 aa  82.8  3e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  35.62 
 
 
215 aa  83.2  3e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.91 
 
 
204 aa  82.8  3e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.71 
 
 
208 aa  82.4  4e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.79 
 
 
204 aa  82.4  4e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  34.47 
 
 
201 aa  82.4  4e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
208 aa  82  5e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
211 aa  82.4  5e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.23 
 
 
209 aa  82  5e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 
203 aa  82  6e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 
211 aa  81.6  7e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 
204 aa  81.3  9e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 
203 aa  81.3  9e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  30.92 
 
 
208 aa  80.9  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 
204 aa  81.3  1e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 
204 aa  80.5  1e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 
208 aa  80.9  1e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  29.02 
 
 
210 aa  80.5  1e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 
208 aa  80.1  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 
204 aa  80.1  2e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
213 aa  80.5  2e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 
210 aa  80.1  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.73 
 
 
205 aa  80.1  2e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
204 aa  80.5  2e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 
211 aa  80.5  2e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
210 aa  79.3  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.53 
 
 
218 aa  79.7  3e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
204 aa  79.7  3e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.23 
 
 
208 aa  79.3  3e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
227 aa  79  4e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.77 
 
 
211 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.77 
 
 
211 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.13 
 
 
208 aa  79  4e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
204 aa  79.3  4e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  78.6  5e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  78.6  5e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  78.6  5e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.99 
 
 
211 aa  78.6  5e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 
211 aa  78.6  6e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 
212 aa  78.2  7e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
204 aa  78.2  7e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.7 
 
 
204 aa  78.2  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.7 
 
 
204 aa  78.2  8e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.15 
 
 
208 aa  78.2  8e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 
205 aa  78.2  8e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
213 aa  77.8  1e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33.7 
 
 
204 aa  77.4  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
213 aa  77.8  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.45 
 
 
209 aa  77.4  1e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
217 aa  76.6  2e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  33.61 
 
 
217 aa  76.6  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  29.78 
 
 
209 aa  76.6  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  28.81 
 
 
209 aa  76.6  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
208 aa  77  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 
208 aa  76.6  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  33.61 
 
 
203 aa  76.3  3e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  33.61 
 
 
203 aa  76.3  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  33.61 
 
 
203 aa  76.3  3e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.35 
 
 
206 aa  76.3  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  33.82 
 
 
213 aa  76.3  3e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
204 aa  76.3  3e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  33.61 
 
 
203 aa  76.3  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>