171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3606 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 130 aa  269  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  89.15 
 
 		 130 aa  243  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  89.23 
 
 		 130 aa  243  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  78.91 
 
 		 129 aa  213  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  44.96 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  48.39 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  53.28 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  47.2 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  45.9 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  44 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  46.61 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  43.44 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  48.44 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  43.2 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  37.98 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  36.22 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.92 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  33.87 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.75 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.43 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.22 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.07 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  33.6 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  37.11 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.89 
 
 		 319 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.54 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  29.57 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.86 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  28.91 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  31.3 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.08 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.53 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.28 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  25.4 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  33.65 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  32.8 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  30.51 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  29.75 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  29.75 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  30.89 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  29.75 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  34.17 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  30.16 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.55 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.91 
 
 		 548 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  27.2 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  28.23 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  36.19 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  31.53 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  34.62 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.16 
 
 		 550 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.16 
 
 		 550 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  30.16 
 
 		 550 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  32.46 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  30.58 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  28.81 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  30.83 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  30.97 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  33.65 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  25.38 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  27.36 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  25.38 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  28.12 
 
 		 548 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  31 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  31.3 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  33.63 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.69 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  29.91 
 
 		 305 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  26.72 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  29.91 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  33.65 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  28.7 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  28.93 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>