70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3054 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  86.49 
 
 		 680 aa  1235    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1378    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  52.38 
 
 		 693 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  41.56 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  37.76 
 
 		 455 aa  225  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  37.76 
 
 		 455 aa  225  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  37.79 
 
 		 419 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  32.34 
 
 		 418 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  32.09 
 
 		 418 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  33.76 
 
 		 418 aa  187  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  32.98 
 
 		 380 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  34.58 
 
 		 410 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  29.81 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  31.79 
 
 		 419 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  32.3 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  32.69 
 
 		 419 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  36.6 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  31.48 
 
 		 463 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  31.38 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  31.38 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  31.38 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  31.38 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  31.62 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  31.62 
 
 		 619 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  32.84 
 
 		 540 aa  167  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  29.83 
 
 		 427 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  29.83 
 
 		 427 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  31.2 
 
 		 504 aa  163  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  29.88 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  29.6 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  30.56 
 
 		 443 aa  142  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  31.12 
 
 		 438 aa  132  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  30.29 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  30.43 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  34.91 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  28.22 
 
 		 1380 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  37.18 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.27 
 
 		 2182 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  27.47 
 
 		 1202 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.75 
 
 		 1710 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.91 
 
 		 966 aa  57.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 		 1489 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0852  hypothetical protein  27.93 
 
 		 633 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.14 
 
 		 632 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.7 
 
 		 2073 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  28.48 
 
 		 718 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  33.88 
 
 		 202 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  34 
 
 		 812 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  25.27 
 
 		 804 aa  51.2  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.52 
 
 		 633 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  29 
 
 		 2474 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1045 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  27.38 
 
 		 773 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1058 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 777 aa  47.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 757 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 1028 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 		 2171 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1176 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  37.8 
 
 		 993 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  39.58 
 
 		 801 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.08 
 
 		 1501 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4209  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.73 
 
 		 1618 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  48.33 
 
 		 1407 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  42.47 
 
 		 135 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1021 aa  44.3  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 775 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1146 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1023 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>