38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4540 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  100 
 
 		 427 aa  861    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  100 
 
 		 427 aa  861    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  63.61 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  63.61 
 
 		 418 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  62.77 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  63.64 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  63.64 
 
 		 463 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  63.64 
 
 		 463 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  63.64 
 
 		 463 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  62.88 
 
 		 461 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  63.64 
 
 		 463 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  62.23 
 
 		 590 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  62.23 
 
 		 619 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  59.52 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  47.51 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  47.51 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  34.88 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  34.51 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  36.21 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  32.66 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  33.97 
 
 		 679 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  34.23 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  32.4 
 
 		 380 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  30.24 
 
 		 680 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  31.69 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  29.83 
 
 		 681 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  32.13 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  31.1 
 
 		 693 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  28.91 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  30.86 
 
 		 504 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  29.41 
 
 		 666 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  78.31 
 
 		 202 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  30.59 
 
 		 614 aa  129  7.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  29.57 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  31.33 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  33.12 
 
 		 479 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  27.04 
 
 		 718 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  23.77 
 
 		 830 aa  43.5  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>