41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1450 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  98.7 
 
 
463 aa  901    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  98.7 
 
 
463 aa  901    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  99.83 
 
 
590 aa  1071    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1227    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  99.14 
 
 
463 aa  906    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  83.66 
 
 
461 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  98.7 
 
 
463 aa  901    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  98.7 
 
 
463 aa  901    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  70.43 
 
 
418 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  64.25 
 
 
418 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  63.61 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  61.99 
 
 
427 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  61.99 
 
 
427 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  63.87 
 
 
419 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  51.89 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  51.89 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  34.66 
 
 
410 aa  271  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2053  hypothetical protein  97.01 
 
 
160 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  36.17 
 
 
410 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1077  hypothetical protein  96.3 
 
 
134 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1360  hypothetical protein  96.3 
 
 
134 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  33.72 
 
 
679 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  38.08 
 
 
607 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  33.73 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  33.74 
 
 
380 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  32.08 
 
 
681 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  30.79 
 
 
680 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  32.77 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3227  hypothetical protein  82.5 
 
 
142 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.955841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  30.59 
 
 
490 aa  170  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  29.85 
 
 
693 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  29.43 
 
 
443 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  31.71 
 
 
504 aa  153  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  28.49 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  30.79 
 
 
540 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  31.09 
 
 
666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  72.29 
 
 
202 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  29.97 
 
 
446 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  29.33 
 
 
614 aa  118  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  35.95 
 
 
479 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2036  hypothetical protein  32.56 
 
 
360 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>