39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2036 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2036  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  749    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2793  hypothetical protein  41.88 
 
 
322 aa  263  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0564  hypothetical protein  36.04 
 
 
361 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  26.56 
 
 
1099 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  21.23 
 
 
906 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  23.38 
 
 
911 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  21.75 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  24.92 
 
 
906 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  24.92 
 
 
906 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  21.45 
 
 
427 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  24.83 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  21.54 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  22.74 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2393  hypothetical protein  26.35 
 
 
279 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.808456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4172  hypothetical protein  22.13 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0150042  hitchhiker  0.000195592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4566  hypothetical protein  30.21 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  24.03 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  19.87 
 
 
830 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  20.89 
 
 
806 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  21.12 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  32.56 
 
 
463 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  32.56 
 
 
463 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  32.56 
 
 
463 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  32.56 
 
 
463 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  32.56 
 
 
463 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  32.56 
 
 
590 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  37.68 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  32.56 
 
 
619 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  32.56 
 
 
461 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  22.65 
 
 
441 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  28.42 
 
 
515 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  22.63 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  31.88 
 
 
419 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  20.94 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  24.43 
 
 
509 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1282  hypothetical protein  27.18 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  21.58 
 
 
418 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  31.88 
 
 
427 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  31.88 
 
 
427 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>