24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2793 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2793  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0564  hypothetical protein  44.63 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2036  hypothetical protein  41.88 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  28.25 
 
 		 906 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  29.89 
 
 		 806 aa  85.9  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1099 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  25.28 
 
 		 906 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  25 
 
 		 906 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  24.03 
 
 		 911 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  23.89 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  20.91 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  21.7 
 
 		 830 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  23.98 
 
 		 760 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  22.38 
 
 		 536 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  26.27 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  21.64 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  22.27 
 
 		 441 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  22.27 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  22.35 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  23.68 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  22.49 
 
 		 437 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  21.29 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  20.28 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3138  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  27.74 
 
 		 768 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>