27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0564 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0564  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  754    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2793  hypothetical protein  44.63 
 
 
322 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2036  hypothetical protein  36.04 
 
 
360 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  27.31 
 
 
1099 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  23.83 
 
 
906 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  23.57 
 
 
911 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  24.27 
 
 
906 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  23.8 
 
 
806 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  24.27 
 
 
906 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  26.29 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  24.19 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  25.4 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  23.73 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  21.64 
 
 
760 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  25.5 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  27.91 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  23.81 
 
 
535 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  23.81 
 
 
535 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  23.96 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  29.65 
 
 
718 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  24.2 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  20.88 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  22.83 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  22.61 
 
 
380 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4172  hypothetical protein  22.41 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0150042  hitchhiker  0.000195592 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  25.93 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  20.45 
 
 
427 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>