38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1552 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1460    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  23.5 
 
 		 721 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  26.89 
 
 		 773 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  24.84 
 
 		 704 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  25.65 
 
 		 705 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  24.15 
 
 		 744 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  25.06 
 
 		 638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  23.95 
 
 		 702 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  24.92 
 
 		 770 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  23.36 
 
 		 754 aa  87.4  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  25.05 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  26.19 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  24.18 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5142  hypothetical protein  23.81 
 
 		 690 aa  59.3  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  25 
 
 		 406 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  22.82 
 
 		 685 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  28.48 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  28.97 
 
 		 683 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  23.7 
 
 		 675 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  29.11 
 
 		 680 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  24.4 
 
 		 416 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2520  hypothetical protein  31.87 
 
 		 550 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  28.37 
 
 		 380 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  21.17 
 
 		 437 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  22.96 
 
 		 441 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  25.38 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0564  hypothetical protein  29.65 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1127  hypothetical protein  26.88 
 
 		 548 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  27.04 
 
 		 427 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  27.04 
 
 		 427 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  24.52 
 
 		 427 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  26.11 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  29.1 
 
 		 463 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  25.13 
 
 		 830 aa  44.3  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  29.06 
 
 		 463 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  29.06 
 
 		 463 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  29.06 
 
 		 463 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  29.06 
 
 		 463 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>