29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4442 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  100 
 
 
685 aa  1404    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  47.32 
 
 
675 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  47.25 
 
 
682 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  26.73 
 
 
557 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  24.82 
 
 
690 aa  163  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  23.48 
 
 
704 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  22.86 
 
 
702 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  25.39 
 
 
705 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  23.42 
 
 
721 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  23.58 
 
 
770 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  21.99 
 
 
773 aa  111  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  23.5 
 
 
744 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  23.42 
 
 
754 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  25 
 
 
380 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  23.41 
 
 
906 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  25.57 
 
 
395 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  22.54 
 
 
395 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  22.66 
 
 
911 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  22.82 
 
 
718 aa  53.9  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  24.32 
 
 
406 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  23.02 
 
 
906 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  31.67 
 
 
663 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  29.09 
 
 
715 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4556  hypothetical protein  21.39 
 
 
676 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000198635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  26.79 
 
 
760 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  26.67 
 
 
726 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  26.14 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  24.88 
 
 
430 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  21.86 
 
 
427 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>