34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5556 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  55.48 
 
 		 705 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  100 
 
 		 704 aa  1454    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  54.29 
 
 		 744 aa  771    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  68.79 
 
 		 702 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  39.49 
 
 		 721 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  27.27 
 
 		 770 aa  258  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  26.99 
 
 		 773 aa  251  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  25.48 
 
 		 754 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  23.48 
 
 		 685 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  24.84 
 
 		 718 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  22.74 
 
 		 675 aa  97.8  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  20.8 
 
 		 557 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  22.2 
 
 		 682 aa  80.9  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  22.35 
 
 		 715 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  28.99 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  27.56 
 
 		 690 aa  67.4  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  23.68 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  23.31 
 
 		 535 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  26.84 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  26.15 
 
 		 430 aa  51.2  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  25.44 
 
 		 345 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  27.51 
 
 		 406 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  24.86 
 
 		 760 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  22.36 
 
 		 380 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  23.94 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  24.85 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  24.75 
 
 		 442 aa  45.8  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  26.15 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  24.02 
 
 		 806 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  22.68 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  23.44 
 
 		 911 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4471  protein of unknown function DUF187  23.53 
 
 		 357 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>