17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2409 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  100 
 
 		 690 aa  1409    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  28.36 
 
 		 675 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  24.82 
 
 		 685 aa  163  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  29.55 
 
 		 682 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  24.86 
 
 		 754 aa  138  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  23.62 
 
 		 721 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  24.51 
 
 		 702 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  22.06 
 
 		 557 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  23.79 
 
 		 705 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  22.85 
 
 		 744 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  28.28 
 
 		 773 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  26.42 
 
 		 770 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  27.56 
 
 		 704 aa  67.4  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  24.7 
 
 		 669 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  23.01 
 
 		 715 aa  47.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5142  hypothetical protein  23.24 
 
 		 690 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  23.53 
 
 		 683 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>