42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0556 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  53.98 
 
 		 702 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  60.85 
 
 		 744 aa  843    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  55.48 
 
 		 704 aa  805    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  100 
 
 		 705 aa  1415    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  38.99 
 
 		 721 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  30.99 
 
 		 773 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  29.17 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  24.86 
 
 		 754 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  25.39 
 
 		 685 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  25.65 
 
 		 718 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  21.29 
 
 		 557 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  23.79 
 
 		 690 aa  99.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  26.13 
 
 		 715 aa  87.8  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  26.29 
 
 		 675 aa  87.4  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  24.12 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  21.74 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  29.77 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  23.55 
 
 		 683 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  28.24 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  28.91 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  25.26 
 
 		 535 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  25.26 
 
 		 535 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  26.47 
 
 		 760 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  30.07 
 
 		 430 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  25.75 
 
 		 717 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  25.17 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  29.38 
 
 		 383 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1137 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  25 
 
 		 688 aa  49.3  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  27.69 
 
 		 380 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  23.57 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  23.26 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  23.95 
 
 		 519 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  33.07 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  22.86 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  23.48 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  30.07 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  22.98 
 
 		 685 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  23.94 
 
 		 393 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5142  hypothetical protein  23.41 
 
 		 690 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  25.13 
 
 		 519 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  23.67 
 
 		 519 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>