22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2556 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  100 
 
 		 1137 aa  2349    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  32 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  21.54 
 
 		 671 aa  58.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  21.08 
 
 		 672 aa  57  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  33.75 
 
 		 721 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  20.43 
 
 		 701 aa  55.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  21.66 
 
 		 674 aa  54.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  21.6 
 
 		 685 aa  51.6  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  40.62 
 
 		 705 aa  50.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  21.43 
 
 		 686 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  21.15 
 
 		 687 aa  50.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  21.43 
 
 		 686 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  21.85 
 
 		 670 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  21.87 
 
 		 685 aa  48.9  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  30.3 
 
 		 702 aa  48.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  28.23 
 
 		 682 aa  48.5  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  20.59 
 
 		 685 aa  48.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  20.65 
 
 		 688 aa  48.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  22.04 
 
 		 686 aa  47.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  20.1 
 
 		 669 aa  47.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  22.16 
 
 		 685 aa  46.2  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  25.58 
 
 		 685 aa  46.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>