36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6215 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  93.54 
 
 		 418 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  71.84 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  63.61 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  63.61 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  61.24 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  64.89 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  62.86 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  63.66 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  63.66 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  63.66 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  63.66 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  63.28 
 
 		 590 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  63.28 
 
 		 619 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  52.84 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  52.84 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  33.9 
 
 		 410 aa  275  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  37 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  32.32 
 
 		 679 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  32.34 
 
 		 681 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  31.96 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  31 
 
 		 680 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  35.48 
 
 		 607 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  32.08 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  33.53 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  32.24 
 
 		 693 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  32.54 
 
 		 666 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  30.17 
 
 		 443 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  30.38 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  30.99 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  28.96 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  31.53 
 
 		 540 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  78.31 
 
 		 202 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  31.53 
 
 		 614 aa  139  8.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  30.79 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  35.86 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>