79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4566 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4566  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  30.46 
 
 
383 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  29.95 
 
 
535 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  29.62 
 
 
380 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  28.81 
 
 
535 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  28.27 
 
 
441 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  29.69 
 
 
420 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  28.86 
 
 
760 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  27.57 
 
 
437 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  27.12 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  28.85 
 
 
416 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  26.8 
 
 
430 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  27.73 
 
 
384 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  27.2 
 
 
427 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  27.2 
 
 
427 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  28.23 
 
 
390 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  28.22 
 
 
395 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  26 
 
 
430 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  26.63 
 
 
410 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  28.85 
 
 
345 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4471  protein of unknown function DUF187  27.03 
 
 
357 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  22.73 
 
 
1099 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  22.78 
 
 
551 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  23.5 
 
 
515 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  21.65 
 
 
437 aa  57  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  20.77 
 
 
906 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  24.56 
 
 
427 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  24.56 
 
 
427 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  24.56 
 
 
427 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  21.84 
 
 
439 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  21.84 
 
 
439 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  20.45 
 
 
906 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  24.22 
 
 
508 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  21.84 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  21.84 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  21.84 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  21.96 
 
 
384 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  21.52 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  21.52 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  21.52 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  22.27 
 
 
442 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  21.5 
 
 
523 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  21.22 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  21.91 
 
 
486 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  24.12 
 
 
509 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  21.43 
 
 
906 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2036  hypothetical protein  30.21 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  23.67 
 
 
406 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  20.54 
 
 
431 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  19.73 
 
 
729 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  23.76 
 
 
570 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  23.21 
 
 
534 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  21.53 
 
 
521 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.84 
 
 
730 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  20.92 
 
 
528 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  23.11 
 
 
533 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  22.54 
 
 
540 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  24.17 
 
 
519 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  25.42 
 
 
768 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  21.43 
 
 
911 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.07 
 
 
729 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  20.49 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  20.06 
 
 
517 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  22.93 
 
 
520 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  21.85 
 
 
806 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  27.09 
 
 
521 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  27.09 
 
 
521 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  24.88 
 
 
521 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  27.09 
 
 
521 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  27.09 
 
 
554 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  20.46 
 
 
538 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  20 
 
 
997 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  24.88 
 
 
494 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.7 
 
 
718 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  22.48 
 
 
532 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  21.13 
 
 
538 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  22.48 
 
 
717 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  30.1 
 
 
726 aa  42.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>