36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1139 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  896    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  37.36 
 
 
443 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  36.31 
 
 
419 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  34.97 
 
 
490 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  37.04 
 
 
380 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  34.04 
 
 
455 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  34.04 
 
 
455 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  34.42 
 
 
419 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  54.66 
 
 
479 aa  186  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  31.55 
 
 
607 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  30.27 
 
 
410 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  28.96 
 
 
418 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  28.91 
 
 
427 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  28.91 
 
 
427 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  28.23 
 
 
418 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  28.66 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  29.82 
 
 
679 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  29.13 
 
 
419 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  29.46 
 
 
461 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  29.04 
 
 
504 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  29.91 
 
 
410 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  28.36 
 
 
590 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  28.36 
 
 
619 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  28.36 
 
 
463 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  28.36 
 
 
463 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  28.36 
 
 
463 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  28.36 
 
 
463 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  29.17 
 
 
418 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  30.05 
 
 
666 aa  139  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  26.65 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  31.12 
 
 
681 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  31.93 
 
 
680 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  30.86 
 
 
693 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  28.57 
 
 
614 aa  112  9e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  26.89 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  42.31 
 
 
202 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>