More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1912 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.99 
 
 		 700 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.76 
 
 		 704 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.7 
 
 		 694 aa  786    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.86 
 
 		 701 aa  1346    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.81 
 
 		 706 aa  938    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.12 
 
 		 700 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.05 
 
 		 704 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.07 
 
 		 686 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.38 
 
 		 706 aa  926    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  54.64 
 
 		 699 aa  736    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.35 
 
 		 695 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.67 
 
 		 706 aa  934    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.18 
 
 		 790 aa  1111    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  76.46 
 
 		 701 aa  1107    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.79 
 
 		 750 aa  720    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.88 
 
 		 703 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.64 
 
 		 696 aa  666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.57 
 
 		 697 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  55.13 
 
 		 728 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.22 
 
 		 700 aa  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  55.06 
 
 		 699 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 695 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  54.92 
 
 		 727 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  54.21 
 
 		 699 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  57 
 
 		 729 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 701 aa  1407    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 696 aa  660    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.39 
 
 		 702 aa  871    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 		 731 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.92 
 
 		 697 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.82 
 
 		 690 aa  737    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.29 
 
 		 729 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.57 
 
 		 694 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.44 
 
 		 729 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 695 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.31 
 
 		 702 aa  831    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.65 
 
 		 691 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.66 
 
 		 685 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.06 
 
 		 723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.65 
 
 		 709 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.73 
 
 		 679 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.84 
 
 		 678 aa  551  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.66 
 
 		 701 aa  551  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.31 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.35 
 
 		 693 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.31 
 
 		 686 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.08 
 
 		 705 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 704 aa  502  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 704 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.06 
 
 		 717 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.61 
 
 		 686 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.04 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 767 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 693 aa  492  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.07 
 
 		 705 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.71 
 
 		 691 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.52 
 
 		 690 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 		 690 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 		 712 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 693 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 693 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 693 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.17 
 
 		 747 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 		 765 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.82 
 
 		 691 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  42.34 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 		 692 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 829 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.83 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.76 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.83 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.89 
 
 		 772 aa  485  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.54 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 		 693 aa  485  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  42.34 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 693 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 696 aa  482  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.98 
 
 		 683 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 		 693 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.56 
 
 		 832 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.26 
 
 		 692 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 703 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 693 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 696 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.26 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.62 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 		 693 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 		 693 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 		 693 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>