More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0024 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 473 aa  964    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  53.77 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 458 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.87 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.67 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  48.79 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  48.38 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  46.8 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.62 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  43.47 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  42.64 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.3 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.3 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.47 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 469 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 501 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  39.4 
 
 		 469 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.13 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.53 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.09 
 
 		 495 aa  289  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 507 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 523 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.62 
 
 		 515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.12 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.54 
 
 		 497 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.22 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 503 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.56 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.45 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 509 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 488 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 509 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 487 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 501 aa  276  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 501 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 488 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 488 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 488 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.97 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  35.97 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.29 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 476 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 502 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 502 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 502 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 498 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 492 aa  273  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 511 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 507 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.31 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 502 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  40.1 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 562 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 546 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  34.99 
 
 		 561 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 564 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 564 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 499 aa  269  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 488 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>