More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3481 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.05 
 
 
259 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4382  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.08 
 
 
260 aa  358  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.691791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0538  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.35 
 
 
265 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.37 
 
 
260 aa  296  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.97 
 
 
262 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
262 aa  291  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 
246 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.13 
 
 
247 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 
246 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
255 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.04 
 
 
247 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
251 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
251 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
248 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
254 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
267 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
256 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
280 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
255 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
248 aa  152  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
248 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
282 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
272 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
252 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
271 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
246 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.05 
 
 
255 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
256 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
252 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
250 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
269 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
258 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
252 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
252 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
253 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  36.26 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.76 
 
 
246 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
246 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
253 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
268 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
259 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  36.47 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
272 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
251 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
261 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
251 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.2 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
257 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  32.81 
 
 
247 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
254 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 
254 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
251 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 
253 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
270 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
262 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
279 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
270 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
259 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 
272 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 
272 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
253 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
251 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
255 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
262 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  34.88 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
247 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
252 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
277 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
257 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
247 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
279 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.94 
 
 
261 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
246 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.41 
 
 
246 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
254 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
261 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
258 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>