87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2037 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  41.16 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  31.93 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  36.24 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  37.17 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  31.63 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  32.91 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  32.49 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  27.05 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  32.76 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  34.64 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  34.86 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  33.8 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  34.64 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  26.14 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  28.27 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  33.18 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  26.18 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  26.44 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  25.22 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  28.42 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  24.5 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  25.89 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  26.18 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  26.84 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.41 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  24.46 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  23.89 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.66 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.66 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.66 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.66 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  26.69 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.21 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  24.29 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.66 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  23.92 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.21 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  23.53 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  23.53 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  23.53 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  23.81 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  23.53 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  24.68 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  24.29 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.67 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.7 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.57 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  22.34 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  21.72 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  24.59 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.68 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  24.26 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  28.47 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.45 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  25.14 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  27.14 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  23.16 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  21.84 
 
 		 370 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.5 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  24.6 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  22.7 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  25.6 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  21.43 
 
 		 584 aa  49.7  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.42 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  23.56 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.99 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  24.35 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  23.08 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  23.03 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  21.46 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  19.74 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2753  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.249359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  19.23 
 
 		 337 aa  45.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  25.18 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  24.75 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.54 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  24.54 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  20.86 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.56 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  18.26 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  22.81 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  29.63 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  23.05 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>