23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  91.27 
 
 		 309 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  50.8 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  50.8 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  50 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  51.91 
 
 		 296 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  48.48 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  31.6 
 
 		 333 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  32.04 
 
 		 314 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  34.26 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  33.19 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  25.99 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  26.9 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.32 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  23.78 
 
 		 584 aa  52.4  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  26.09 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  27.01 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  31.02 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  25.95 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  25.95 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  25.88 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  23.5 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>