86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0553 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  613  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  44.86 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  34.69 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  41.18 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  34.86 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  36.42 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  28.92 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  29.05 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  32.04 
 
 		 252 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  28.09 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  36.05 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  31.56 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.75 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  25.88 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  25.86 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  25.78 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  26.84 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  26.84 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  24.71 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  27.91 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  25.29 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.66 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  21.47 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  26.81 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  26.63 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  25.6 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  26.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  24.71 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  27.98 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.43 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.43 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.43 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  27.43 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.43 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  26.09 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  28.51 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.58 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  23.36 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.86 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.71 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  26.75 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.86 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  26.16 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  26.16 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  26.16 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  25.44 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  25.15 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  26.16 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  23.68 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.81 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  24.26 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  26.16 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.44 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  26.16 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  27.01 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  25.44 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  22.22 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  24.59 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.74 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  24.59 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  23.53 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.76 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.01 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  24.56 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  26.64 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  22.99 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  26.55 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.45 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.45 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  21.76 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  28.16 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  21.76 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  30.66 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  22.46 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  23.81 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  22.81 
 
 		 349 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.12 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24.02 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  23.08 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>