25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1696 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  98.65 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  90.29 
 
 		 296 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  82.09 
 
 		 296 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  60.34 
 
 		 310 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  50.89 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  49.6 
 
 		 252 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  35.91 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  32.43 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  33.9 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  29.86 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  26.01 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  27.33 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  27.91 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  29.01 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  29.37 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  29.57 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  29.06 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  29.06 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  31.43 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  23.53 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.94 
 
 		 584 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  26.72 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>