23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3495 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  83.81 
 
 		 296 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  82.73 
 
 		 296 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  84.53 
 
 		 296 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  62.76 
 
 		 310 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  50.18 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  50.4 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  36.05 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  32.97 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  36.05 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  34.12 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  34.08 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  27.36 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  26.35 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  27.33 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.71 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  28.4 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  23.67 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  26.72 
 
 		 329 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  25 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  29.67 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  27.59 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>