22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3662 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  91.27 
 
 		 252 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  50.89 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  50.89 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  48.82 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  52.26 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  47.3 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  33.18 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  29.05 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  33.62 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  31.88 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  25.25 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  35.21 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  22.15 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.72 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  23.91 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  26.09 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  24.35 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  30.59 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  26.44 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  24.35 
 
 		 584 aa  49.3  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  23.66 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>