35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3415 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  34.86 
 
 
314 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  32.38 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  35.66 
 
 
324 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  37.2 
 
 
310 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  38.04 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  36.92 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  36.41 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  33.62 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  36.05 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  30.94 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  29.57 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  35.36 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  32.74 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  26.41 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  26.77 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  28.45 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  25.87 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  32.13 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  25.41 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  25.82 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  31.03 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  22.81 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  22.79 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  28.77 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  22.5 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.75 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  30.53 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.96 
 
 
289 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  19.51 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  28.92 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  23.67 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  21.43 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  32.04 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>