31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1661 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  38.11 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  31.54 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  36.81 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  36.71 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  31.19 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  34.03 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  34.05 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  32.18 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  29.7 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  32.97 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  31.89 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  32.43 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  31.58 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  32.16 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  25.58 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  25.18 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  27.72 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0509  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  30.67 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  21.4 
 
 		 584 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.11 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  24.59 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  25.55 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.6 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.86 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  27.75 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  24.42 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  24.12 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.23 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3001  hypothetical protein  19.83 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.47 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>