18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1098 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1098  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  603  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  28.46 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  27.05 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  28.05 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  26.77 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1361  hypothetical protein  38.26 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  24.39 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43660  hypothetical protein  27.01 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370593  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3743  hypothetical protein  23.53 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3662  hypothetical protein  26.44 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4210  hypothetical protein  25.43 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  27.43 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  24.78 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  27.12 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1696  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4172  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3495  hypothetical protein  29.67 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>